<rdf:RDF
    xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#"
    xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"
    xmlns:ns5="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_rib102i/"
    xmlns:ns0="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_ria227i/"
    xmlns:rdfs="http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#"
    xmlns:ns7="http://metadb.riken.jp/meta/1.0/"
    xmlns:ns9="http://creativecommons.org/ns#"
    xmlns:foaf="http://xmlns.com/foaf/0.1/"
    xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#"
    xmlns:ns3="http://database.riken.jp/sw/item/">
  <rdf:Description rdf:about="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_ria227i/cria227s8ria227u124962001000i">
    <ns0:pria227s1i>
      <ns0:cria227s2i rdf:about="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria227u124962001000i">
        <ns0:pria227s3i rdf:resource="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_rib102i/crib102u0rib102u10000049620i"/>
        <ns0:pria227s9i rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#decimal"
        >0.55019200000000001438</ns0:pria227s9i>
        <ns9:attributionURL rdf:resource="http://matome.base.riken.jp/omat_gene_db/gene_info/gene_info.cgi?id=AT1G49620.1"/>
        <dc:description xml:lang="en">&lt;html&gt;&lt;body&gt;&lt;title&gt;AT1G49620.1&lt;/title&gt;(&amp;uarr; Click "Links", if this line appears at the beginning.)&lt;br&gt;&lt;H1&gt;Other supporting information&lt;/H1&gt;&lt;table&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan="2" align="left"&gt;&lt;b&gt;Gene Model&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP width="75"&gt;&lt;/td&gt;&lt;td NOWRAP&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/AT1G49620.1.gene_models.png" width="717"&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=2 align="left"&gt;&lt;b&gt;Correlation Plot&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP colspan="2" align="left"&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/AT1G49620.1.CorrPlot.jpg" width="800"&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Expression profile (Values are plotted in Log(2) values.)&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/AT1G49620.1.F0.Expression.png"&gt;&lt;br&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Genes with related expresssion profiles.&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;table border=1&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Positively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u220769801000i"&gt;AT2G07698.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.896538&lt;/td&gt;&lt;td&gt;ATP synthase alpha chain, mitochondrial, putative&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u123243001000i"&gt;AT1G32430.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.892561&lt;/td&gt;&lt;td&gt;F-box family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u320578001000i"&gt;AT3G05780.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.892321&lt;/td&gt;&lt;td&gt;LON3 (LON PROTEASE 3)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u221614501000i"&gt;AT2G16145.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.889741&lt;/td&gt;&lt;td&gt;MIR416&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u290000003000i"&gt;ath-MIR416&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.889741&lt;/td&gt;&lt;td&gt;ath-MIR416&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u523579201000i"&gt;AT5G35792.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.887313&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u421909001000i"&gt;AT4G19090.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.885244&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u521754001000i"&gt;AT5G17540.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.883274&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transferase family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P105080&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u523572501000i"&gt;AT5G35725.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.881066&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u322193001000i"&gt;AT3G21930.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.878985&lt;/td&gt;&lt;td&gt;receptor-like protein kinase-related&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Negatively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u324814001000i"&gt;AT3G48140.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.803705&lt;/td&gt;&lt;td&gt;senescence-associated protein, putative&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P012480&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u120794001000i"&gt;AT1G07940.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.779723&lt;/td&gt;&lt;td&gt;elongation factor 1-alpha / EF-1-alpha&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P102410&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u520238001000i"&gt;AT5G02380.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.713102&lt;/td&gt;&lt;td&gt;MT2B (METALLOTHIONEIN 2B)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P100430&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u320247001000i"&gt;AT3G02470.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.710773&lt;/td&gt;&lt;td&gt;SAMDC (S-ADENOSYLMETHIONINE DECARBOXYLASE)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P000660&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P100630&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u223757001000i"&gt;AT2G37570.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.689014&lt;/td&gt;&lt;td&gt;SLT1 (sodium- and lithium-tolerant 1)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT2P108830&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u224322001000i"&gt;AT2G43220.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.683787&lt;/td&gt;&lt;td&gt;DC1 domain-containing protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u423915001000i"&gt;AT4G39150.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.681706&lt;/td&gt;&lt;td&gt;DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u522001001000i"&gt;AT5G20010.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.679435&lt;/td&gt;&lt;td&gt;RAN-1&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u521195001000i"&gt;AT5G11950.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.678138&lt;/td&gt;&lt;td&gt;protein homodimerization&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P004100&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u326065001000i"&gt;AT3G60650.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.677097&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;a href="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/AT1G49620.1-correlation.txt"&gt;Get whole results&lt;/a&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt; &lt;HR&gt;&lt;b&gt;Over-Representation Analysis Result&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr bgcolor=#FF69B4&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;:20 terms with high significance&lt;/td&gt;&lt;/a&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFACD&gt;&lt;td&gt;1.00e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 8.76e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;                  :With considering multiple testing correction;&lt;br&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt; &lt;=  1.00e-02 / 1142&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;8.76e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-02&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Type of term (*1)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Depth of the term in ontology tree&lt;/th&gt;&lt;th&gt;ID/Term&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Description&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Number of genes&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Over-Representative rate (*2)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*3)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PosMed &lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*4)&lt;br&gt; (Link to PosMed)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Found on gene annotation&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;similar&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;18/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.74&lt;/td&gt;&lt;td&gt;8.03e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="http://omicspace.riken.jp/PosMed/search?actionType=searchexec&amp;objectSet=gene&amp;species=At&amp;condition=GeneIds&amp;associationDirectMode=2&amp;associationRelationMode=2&amp;geneIds1=AT1G49620&amp;keyword=similar"&gt;2.29E-15&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;table&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*1)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;[KW]:words found in gene description.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*2)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;([# of genes with the term] / [# of sampling (200)]) / ([# of genes with the term among whole genes] / [# of whole genes])          &lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*3)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;P-values were calculated on hypergeometric distribution in which we found &lt;i&gt;n&lt;/i&gt; genes with a annotation term during 200           highly correlated genes, while we had &lt;i&gt;N&lt;/i&gt; genes           with the term in the whole genes.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*4)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="http://omicspace.riken.jp/PosMed-plus/"&gt;PosMed&lt;/a&gt; is a system which serve a p-values showing a relationship           between the gene and the annotation term based on literature information and Gene-Gene interaction suchas co-expression or           protein-protein interactions.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s904i"&gt;Top Page&lt;/a&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</dc:description>
        <rdfs:seeAlso rdf:resource="http://database.riken.jp/sw/item/cria227s2ria227u124962001000i"/>
        <foaf:depiction rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/AT1G49620.1.CorrPlot.jpg"/>
        <ns7:hasFile rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/description.html"/>
        <foaf:depiction rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/AT1G49620.1.F0.Expression.png"/>
        <ns0:pria227s6i rdf:resource="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_ria227i/cria227s11ria227u124962001000i"/>
        <ns7:hasFile rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/AT1G49620.1.ArrayResult.pdf"/>
        <ns0:pria227s43i xml:lang="en">without_OMAT_gene</ns0:pria227s43i>
        <rdfs:label xml:lang="en">AT1G49620.1</rdfs:label>
        <ns7:hasFile rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/AT1G49620.1-correlation.txt"/>
        <foaf:depiction rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u124962001000i/AT1G49620.1.gene_models.png"/>
      </ns0:cria227s2i>
    </ns0:pria227s1i>
  </rdf:Description>
</rdf:RDF>